阿塔卡的小队在黑曜石祭坛前陷入苦战。暗紫色藤蔓组成的牢笼将众人困住，祭坛水晶的吸力愈发强大，生命圣果的光芒几乎被完全吞噬。阿塔卡突然想起大地之灵的预言，咬破手指将鲜血滴在翡翠图腾上。图腾爆发出耀眼的绿光，藤蔓在强光中蜷缩枯萎。他趁机跃上祭坛，将翡翠图腾插入水晶缝隙。随着一声巨响，水晶爆裂，生命圣果重新绽放光芒，同时释放的能量波将所有骨龙化为灰烬。
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但危机并未解除。祭坛下方传来低沉的轰鸣，一个巨大的暗紫色漩涡缓缓展开，从中走出三名身披黑袍的熵暗祭祀。他们手中的权杖顶端镶嵌着破碎的生命圣果残片，权杖挥舞间，星云的能量开始逆向流动，所有被净化的骸骨再次复活。“这些圣果残片……是被腐化的仿制品！”阿塔卡瞳孔骤缩，意识到自己落入了敌人的圈套。
量子计算机的解析进度终于达到100%，艾琳娜得到了惊人的信息：熵暗余孽的首领竟是宇宙诞生初期的“秩序仲裁者”。因目睹太多文明的贪婪与堕落，仲裁者试图用熵暗之力重置宇宙。他在虚数之海深处建造了“熵暗熔炉”，通过吸收现实宇宙的文明能量来锻造本源之力。而想要摧毁熔炉，必须集齐七颗完整的生命圣果与三把秩序钥匙，在熵暗之喉核心发动“创世共鸣”。
新生命与诺娅按照艾琳娜的提示，将超维钥匙插入调和之核的能量接口。金银双色光芒与金色光芒交织，形成一个巨大的能量矩阵。矩阵产生的共振波瞬间削弱了熵暗领主的防御，诺娅抓住机会，操控神骸的创世裁决斩向晶体。晶体破碎的刹那，熵暗领主发出震天怒吼，身体开始崩解。但与此同时，剩余的四根水晶柱突然剧烈震动，释放出的能量将整个空间撕裂成无数碎片。
阿塔卡的小队在星云的战斗进入白热化。三名熵暗祭祀召唤出的骨龙军团数量远超想象，翡翠图腾的光芒在不断消耗中变得黯淡。年轻萨满突然想起星光星球守护者的提示，他将五颗生命圣果排列成特殊阵型，圣果之间的光芒相互连接，形成一个巨大的绿色结界。结界内，所有骨龙的行动速度大幅减缓，阿塔卡趁机带领族人发动总攻。
机械文明的星舰能源核心温度突破临界值，艾琳娜决定孤注一掷。她将三把秩序钥匙插入星舰主炮的能量核心，启动“秩序坍缩炮”。巨大的金色光束射向熵暗生物军团，所过之处空间发生折叠，所有熵暗生物被压缩成微小的紫色颗粒。但这次攻击也让星舰能源核心彻底过载，艾琳娜紧急启动逃生程序，在星舰爆炸前的最后一刻，带着量子计算机的核心数据撤离。
新生命与诺娅在破碎的空间中艰难前行，他们的周围漂浮着各个文明的记忆残片。超维钥匙与调和之核的能量共振产生了奇异效果，这些记忆残片开始凝聚成实体，形成一支由虚拟战士组成的军队。这些战士来自不同的文明，他们的武器和装备形态各异，但眼神中都闪烁着坚定的光芒。“是所有文明的信念在支持我们！”诺娅操控神骸指挥虚拟军队，向剩余的熵暗生物发起反击。
阿塔卡成功击败三名熵暗祭祀，拿到了第六颗生命圣果。但在离开星云时，他发现祭祀的尸体下藏着一张星图，图上标记着第七颗圣果的位置——在宇宙边缘的“永夜深渊”。那里是被遗忘的黑暗领域，传说连光线都会被吞噬。阿塔卡看着手中的圣果，深知无论前方有多危险，他都必须前往。
艾琳娜带着量子计算机的数据在太空中漂流，幸运地被一支机械文明的救援队发现。她立即将关于熵暗熔炉和创世共鸣的信息传递给新生命与诺娅。此时，新生命和诺娅已经摧毁了最后一根水晶柱，但熵暗本源的球体却开始膨胀，释放出的能量波动足以摧毁整个星系。
“创世共鸣需要七颗圣果和三把钥匙同时发动，缺一不可！”艾琳娜的声音通过量子通讯器传来，“阿塔卡正在寻找最后一颗圣果，你们必须守住这里，等待他的到来！”新生命握紧超维钥匙，诺娅的神骸装甲重新启动防御立场，他们知道，真正的决战还未到来。而在虚数之海深处，熵暗余孽的首领注视着现实宇宙发生的一切，他的嘴角勾起一抹冷笑，因为他早已在永夜深渊设下了致命陷阱，等待着阿塔卡和所有文明的到来。
在永夜深渊的入口，阿塔卡的穿梭舰被一股无形的力量阻挡。星图显示，想要进入深渊，必须解开三道由熵暗能量组成的谜题。第一道谜题是一个不断变化的时空迷宫，进入其中的人会陷入时间循环。阿塔卡让族人在入口处设置翡翠信标，自己则带着两名精锐战士踏入迷宫。他们每走一步，周围的场景就会变换，有时是翡翠星的森林，有时是被熵暗侵蚀的废墟。
“不要被幻象迷惑！”阿塔卡提醒同伴，“迷宫的规律应该与星图上的符文有关。”他仔细观察地面上若隐若现的暗紫色纹路，突然发现这些纹路组成的图案与翡翠图腾上的古老符号存在某种关联。当他按照特定顺序踩踏纹路上的符号时，前方的空间出现了一道绿色的传送门。
然而，穿过传送门后，他们面对的是第二道谜题——一片由暗紫色火焰组成的海洋。这些火焰不仅能燃烧物质，还能灼烧灵魂。阿塔卡尝试用翡翠图腾的力量开辟道路，但火焰在接触图腾的瞬间突然暴涨。一名战士为了保护众人，毅然冲进火焰，用自己的身体为同伴开辟出一条短暂的通道。阿塔卡和另一名战士强忍悲痛，快速穿过火焰，却发现出口处站着一个熟悉的身影——被熵暗腐化的翡翠星大祭司。
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大祭司的眼中闪烁着暗紫色的光芒，手中的权杖顶端缠绕着扭曲的生命圣果残片。“愚蠢的后辈，以为能通过我的考验？”大祭司挥舞权杖，暗紫色的锁链从地面窜出，将阿塔卡两人困住。阿塔卡看着曾经尊敬的大祭司，心中涌起无限悲痛，但他很快冷静下来。“你不是真正的大祭司！”阿塔卡将翡翠图腾贴在锁链上，“大祭司的灵魂永远不会被熵暗污染！”图腾的光芒与锁链激烈碰撞，锁链在净化能量中逐渐崩解。
与此同时，新生命和诺娅在熵暗本源空间的战斗愈发艰难。熵暗本源球体释放的能量形成了一个巨大的暗紫色漩涡，将周围的一切物质和能量都吸入其中。虚拟战士组成的军队在漩涡中不断消散，超维钥匙和调和之核的光芒也变得忽明忽暗。诺娅的神骸装甲出现了致命的裂痕，调和之核的能量即将耗尽。
“我们不能放弃！”新生命将手按在调和之核上，试图用自己的精神力维持能量运转，“阿塔卡一定会带来最后一颗圣果，我们要撑到那一刻！”诺娅操控神骸发动最后的防御立场，神骸的万象装甲重组为盾牌形态，抵挡住了漩涡的强大吸力。但每一秒的坚持，都在消耗着神骸最后的力量。
机械文明的幸存者们在废墟中重建基地，同时修复量子纠缠通讯器。他们发现熵暗余孽正在构建一个巨大的暗熵屏障，一旦屏障完成，所有文明将被彻底隔绝。为了突破屏障，他们开始研发一种能产生“量子相位跃迁”的装置，这种装置可以让星舰短暂进入高维空间，从而绕过屏障。但研发过程中，他们遇到了一个棘手的问题——需要一种名为“星核碎片”的稀有物质作为能量核心，而这种碎片只存在于超新星爆发的中心。
在永夜深渊的第三道谜题前，阿塔卡和战士面对的是一面巨大的镜子。镜子中映照出他们内心最恐惧的景象：翡翠星彻底沦为死星，所有族人都被熵暗同化。“这是幻象……这是幻象……”阿塔卡不断告诉自己，试图保持清醒。但随着时间推移，他发现镜子中的景象开始影响现实，周围的空间逐渐被暗紫色的雾气笼罩。
战士突然举起武器，刺向阿塔卡：“大祭司说得对，我们根本无法对抗熵暗！与其挣扎，不如早点解脱！”阿塔卡侧身躲过攻击，心中充满震惊和悲痛。他知道战士已经被镜子的力量迷惑，必须尽快打破镜子。阿塔卡将五颗生命圣果的力量全部注入翡翠图腾，图腾爆发出前所未有的光芒，光芒射向镜子的瞬间，镜子开始出现裂痕。随着一声巨响，镜子破碎，第三道谜题终于破解。
然而，当阿塔卡穿过最后一道传送门，进入永夜深渊内部时，他看到的不是生命圣果，而是一个巨大的熵暗陷阱。陷阱中央，第七颗生命圣果被锁在一个暗紫色的牢笼中，牢笼周围布满了致命的熵暗能量网。更糟糕的是，熵暗余孽的首领早已在此等候，他的身影在暗紫色的雾气中若隐若现，手中把玩着一颗散发着诡异光芒的熵暗本源结晶。
“欢迎来到这里，翡翠星的萨满。”首领的声音充满嘲讽，“你以为能轻易拿到圣果？这一切都是我为你们准备的‘惊喜’。”他一挥手，无数熵暗生物从深渊的各个角落涌出，将阿塔卡和战士团团围住。阿塔卡握紧翡翠图腾，心中却涌起一股绝望——他知道，自己可能无法活着离开这里，更无法将圣果带给新生命和诺娅。
在熵暗本源空间，新生命和诺娅的处境也到了崩溃边缘。诺娅的神骸装甲彻底碎裂，调和之核停止运转，神骸跪倒在地。新生命的超维钥匙失去光芒，他跪在诺娅身旁，看着逐渐被暗紫色漩涡吞噬的空间，心中充满不甘。就在这时，量子纠缠通讯器突然响起阿塔卡的声音，虽然断断续续，但每一个字都充满了坚定：“我……在永夜深渊……遇到陷阱……但我会想办法……带着圣果……回来……”
机械文明的科研团队终于找到星核碎片，但在采集过程中，他们遭遇了一群被熵暗同化的宇宙海盗。这些海盗驾驶着经过改造的星舰，武器发射的暗紫色光束能轻易穿透星舰护盾。科研团队的星舰在战斗中受损严重，就在他们即将被击败时，一支由各个文明组成的联合舰队突然出现，帮助他们击退了海盗。联合舰队的指挥官通过通讯器说道：“我们收到了机械文明的求援信号，从现在起，我们共同对抗熵暗！”
阿塔卡挥舞翡翠图腾，与熵暗生物展开殊死搏斗。他的族人在深渊入口焦急地等待，却无法提供任何帮助。战士为了保护阿塔卡，不幸被熵暗生物的利爪贯穿身体。临终前，他将最后一颗翡翠箭矢交给阿塔卡：“萨满……一定要带着圣果……完成使命……”阿塔卡含泪接过箭矢，心中的悲痛转化为愤怒和力量。他将所有生命圣果的力量汇聚在翡翠图腾上，图腾发出的光芒照亮了整个永夜深渊。
在光芒的冲击下，熵暗生物纷纷瓦解，熵暗牢笼也出现了裂痕。阿塔卡抓住机会，将翡翠箭矢射向牢笼的核心。箭矢穿透牢笼的瞬间，第七颗生命圣果飞向他的手中。但此时，熵暗余孽的首领突然出现在他身后，暗紫色的能量凝聚成一把利刃，刺向阿塔卡的后背……
新生命和诺娅在熵暗本源空间中，感受到了阿塔卡传递的微弱信念。尽管超维钥匙和调和之核已经失去力量，他们依然挣扎着站起来，准备迎接最后的时刻。周围的暗紫色漩涡加速旋转，整个空间开始崩塌。而在宇宙的各个角落，所有文明都在为了生存而战，他们的命运，将在这场与熵暗的终极对决中，迎来最终的结局。